Automatisiertes Scoring von Tumor Buds

Tumor Budding ist ein unabhängiger Prognosefaktor für Lymphknotenmetastasen bei kolorektalen pT1-Karzinomen und ein Indikator für die Überlebensrate bei Darmkrebs in Stadium II¹.

Ziel: Automatisertes Scoring

Partner: Gemeinsame Initiative mit dem Pathologischen Institut des Uni-Klinikums Erlangen

Aktueller Status:

• Entwicklung einer automatisierten Analyse von immunhistochemischen Färbungen (pan-Cytokeratin – PCK) für die
• Detektion der Tumor-Invasions-Front
• Erkennen der Tumor Buds
• Detektion von Hot Spots und Bestimmung von geringem/mittlerem/hohem Budding auf Basis bestimmter Cut-Off-Wert
• Training des Algorithmus auf 40x PCK gefärbten Whole Slide Images
  

Datenbank: Über 100 Whole Slide Images mit über 50.000 annotierten Tumor Buds

Unsere Lösung:

• Detektion von möglichen Tumor Buds mittels klassischer Bildanalyse: Bestimmung von Größe, Farbe und Entfernung von Tumor
• Aussortieren falsch-positiver Strukturen mittels eines Convolutional Neural Networks, das darauf trainiert ist, Tumor Buds zu klassifizieren
  

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¹Lugli et al, Recommendations for reporting tumor budding in colorectal cancer based on the International Tumor Budding Consensus Conference (ITBCC) 2016

Poster presentation at Global Engage blog - Tumor budding in brightfield immunostained colon sections